Spin off del universo Ghost in the Shell.
Hace 16 años, un grupo terrorista llamado " Brigada del Nuevo Mundo" secuestró a una joven llamada Eka Tokura. Sin embargo, han aparecido fotos recientes de Eka y parece que se ve exactamente igual que hace 16 años.
Para investigar este misterio, la unidad especial de la Guardia Costera fue enviada a una isla artificial frente a la costa de Okinawa donde Eka fue capturada por la Brigada. Sin embargo, la comunicación con la unidad especial se ha perdido, dejando a esta isla y a la Brigada en un manto de secretos.
La Sección 9 tiene la tarea de descubrir qué sucedió en esta isla artificial y descubrir la verdad detrás de las miradas desafiantes de Eka.